Un article de synthèse, dirigé par un scientifique de l’Université de Birmingham, décrit comment les technologies de séquençage émergentes transformeront notre compréhension de ces molécules, menant finalement à de nouvelles cibles médicamenteuses. L’article est publié dans la revue Tendances en biotechnologie.

L’expression de gènes pour fabriquer des protéines implique la fabrication d’une molécule d’ARN messager. Bien que l’ARN, comme l’ADN, soit constitué des quatre nucléotides, certains d’entre eux portent des décorations appelées épitranscriptome. Ces nucléotides modifiés sont des ajouts importants au code génétique dont les fonctions sont peu connues, mais ont été liées à des maladies telles que l’obésité, le cancer et des troubles neurologiques.

Bien que l’importance de l’épitranscriptome soit reconnue, sa détection est difficile et s’accompagne de taux d’erreur élevés.

Les scientifiques se sont intéressés à ces rares nucléotides modifiés depuis leur découverte il y a plus de 40 ans, mais ils avaient été très difficiles à examiner dans des gènes spécifiques en raison de difficultés techniques. Cependant, leur importance a été reconnue, car de nombreux parasites et virus humains en ont. Plus encore, certains virus dont le coronavirus SARS-CoV2 possèdent leurs propres enzymes de modification de l’ARN, acquises à l’origine auprès de leurs hôtes, mais ensuite adaptées à leurs besoins.

Jusqu’à récemment, l’étude de ces nucléotides modifiés a été limitée car ils se produisent si rarement, et les technologies existantes n’ont pas été suffisamment affinées pour détecter les modifications.

La nouvelle technologie, développée par Oxford Nanopore Technologies, promet de surmonter les limitations de séquençage actuelles, avec des capacités de séquençage hautement sélectives. En identifiant des cibles nucléotidiques spécifiques associées à des maladies particulières, les développeurs de médicaments pourront commencer à étudier les médicaments inhibiteurs qui peuvent interférer avec les molécules et influencer la progression de la maladie.

L’auteur principal de cette étude multinationale, le Dr Matthias Soller de l’Université de Birmingham, au Royaume-Uni, déclare: « Ces nucléotides modifiés sont particulièrement difficiles à détecter et auparavant, il était impossible d’examiner leur occurrence dans l’ensemble du génome avec une grande confiance. »

La première auteure et chercheuse scientifique Schmidt, la Dre Ina Anreiter, Université de Toronto, Canada, ajoute: «Auparavant, il n’était possible d’examiner qu’une seule modification à la fois, mais il y en avait plus d’une et ils cachaient probablement un code encore à découvrir .

«Cette nouvelle technologie permettra vraiment un changement radical dans la façon dont nous abordons les nucléotides modifiés, en nous donnant une carte topographique en« temps réel »de l’emplacement des molécules dans le génome et de leur fréquence d’apparition. Ce sera vraiment important pour les instructions. poursuivre les recherches sur leur fonction et nous fournir de nouvelles informations sur la manière dont ces molécules conduisent à des maladies humaines. « 

Le Dr Soller a ajouté: « Il reste encore beaucoup à faire pour développer davantage ces dispositifs de séquençage, y compris l’amélioration de la capacité d’apprentissage automatique pour interpréter les signaux de séquençage, mais les progrès se produisent rapidement et je pense que nous verrons des résultats très intéressants. émergeant de cette technologie. « 

Source de l’histoire:

Matériaux fourni par Université de Birmingham. Remarque: le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.