SAN DIEGO–(FIL D’AFFAIRES)– Élément Biosciences., développeur d’une nouvelle plate-forme de séquençage d’ADN révolutionnaire, a annoncé aujourd’hui des partenariats avec Google DeepVariant et Sentiéon pour l’analyse des appels de variantes. Grâce à ces partenariats, les équipes DeepVariant et Sentieon ont évalué les données Element et généré des modèles d’apprentissage automatique spécifiques à Element. Element continuera à travailler avec les deux équipes pour améliorer encore la qualité et la facilité d’utilisation. Les clients qui achètent un instrument Element se verront offrir une licence Sentieon de 6 mois pour traiter les données Element sans frais.
L’expansion rapide des données de séquençage de nouvelle génération (NGS) et l’utilisation de ces données dans un large éventail de nouvelles applications ont créé un besoin d’outils de calcul améliorés pour le traitement des données.
Google DeepVariant, une technologie d’apprentissage en profondeur, a été spécialement conçue pour reconstruire les séquences du génome à partir des données de séquençage NGS avec une précision nettement supérieure à celle des méthodes classiques précédentes. DeepVariant y parvient en transformant la tâche d’appel de variantes NGS en un problème de classification d’images bien adapté à la technologie et à l’expertise existantes de Google. DeepVariant est disponible sous la licence open source BSD.
Sentieon, un développeur d’algorithmes hautement précis et optimisés pour les applications bioinformatiques, a créé des outils qui sont des alternatives plus rapides et moins chères à la norme de l’industrie pour l’analyse secondaire dans le traitement des données NGS. La technologie Sentieon offre une grande précision et une facilité d’utilisation, tout en améliorant considérablement la vitesse de traitement.
« Nous sommes ravis des partenariats avec Sentieon et Google DeepVariant, et de la haute qualité des données dont notre nouveau système AVITI a fait preuve avec leurs deux algorithmes d’appel de variantes. Cela ne fera qu’améliorer encore l’expérience utilisateur pour tous nos clients respectifs », a déclaré Molly He, Ph.D., PDG et cofondatrice d’Element.
« Nous sommes ravis de soutenir la plateforme de séquençage AVITI d’Element Biosciences lors de son entrée sur le marché NGS », a déclaré Jun Ye, PDG de Sentieon. « Ce partenariat permet aux clients d’Element de bénéficier de chacune de nos forces respectives en matière de génération et d’analyse de données NGS. Ce fut un plaisir de travailler avec Element pour améliorer l’appel des variantes. Leurs données sont de haute qualité constante, ce qui conduit à des résultats d’appel de variantes très précis. Nous sommes impatients de servir leurs clients et de poursuivre nos collaborations. »
« Nous sommes ravis de voir une nouvelle technologie de séquençage », a déclaré Andrew Carroll, chef de produit – génomique chez Google. « Nous avons observé une haute qualité des données avec nos méthodes existantes, et d’autres améliorations avec des approches recyclées. Nous avons constaté des performances particulièrement bonnes à des couvertures inférieures, ce qui suggère qu’Element peut présenter certains avantages en termes de précision de lecture. »
Les résultats détaillés des études avec Sentieon et Google seront publiés le 14 mars 2022.
À propos de Google
La mission de Google est d’organiser les informations mondiales et de les rendre universellement accessibles et utiles. Grâce à des produits et des plates-formes comme la recherche, Maps, Gmail, Android, Google Play, Chrome et YouTube, Google joue un rôle significatif dans la vie quotidienne de milliards de personnes et est devenue l’une des entreprises les plus connues au monde. Google est une filiale d’Alphabet Inc. Pour plus d’informations, visitez notre blog Google AI https://ai.googleblog.com/.
À propos de Sentieon
Sentieon® développe des algorithmes et des logiciels primés, extrêmement précis et hautement optimisés pour les applications de traitement de données bioinformatiques. Sentieon® est une équipe d’ingénieurs professionnels possédant une expertise approfondie dans l’optimisation des algorithmes, des logiciels et des systèmes, acquise grâce à l’expérience du développement d’applications de traitement d’images, de lithographie computationnelle, d’exploration de données à grande échelle et de bioinformatique. Grâce à notre expertise accumulée dans la modélisation, l’optimisation, l’apprentissage automatique et le calcul haute performance, nous nous efforçons de permettre des données de précision pour la médecine de précision. Pour plus d’informations, visitez www.sentieon.com.
À propos d’Element Biosciences, Inc.
Element Biosciences est une société multidisciplinaire des sciences de la vie qui se concentre actuellement sur le développement d’une technologie perturbatrice de séquençage de l’ADN pour les marchés de la recherche et du diagnostic. En innovant chaque élément fondamental d’un système de séquençage, Element offrira aux clients des données abordables de haute qualité et une expérience utilisateur améliorée, ce qui accélérera les découvertes scientifiques et élargira l’utilisation de la médecine génomique. Pour en savoir plus sur Element, veuillez visiter www.elementbiosciences.com.
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